对于此前劳资双方争议较大的双倍工资的时间计算问题，《指导意见（二）》此次也做了界定，即从用人单位不签订书面劳动合同的违法行为结束之次日开始计算一年；如劳动者在用人单位工作已经满一年的，劳动者申请仲裁的时效从一年届满之次日起计算一年。
当劳动合同期满后，劳动者继续在用人单位工作，用人单位超过一个月不满一年不与劳动者订立劳动合同的，劳动者也可诉求用人单位每月支付双倍工资。用人单位超过一年未与劳动者订立书面劳动合同的，视为双方已订立无固定期限劳动合同。
但对于合同期满后，劳动者因为特殊原因，如因为工伤部分丧失劳动能力，或因为生育尚处于哺乳期的，或在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的，劳动合同可以续延，但劳动者不能请求这段期间的双倍工资。
如果用人单位存在没有按约定及时足额支付劳动者工资，或者低于当地最低工资标准支付劳动者工资，或者安排加班不支付加班费等违法情形，经人力资源社会保障部门责令限期支付劳动报酬、加班费、经济补偿、工资差额后，用人单位逾期仍不支付，劳动者可以请求用人单位赔偿应付金额百分之五十以上百分之一百以下的加付赔偿金。
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